军机处为清朝独有，首创者乃雍正帝。雍正为何要设立这么一个机构?根本原因是想有效发挥君主集权的优势，有此动念的起因是一场发生在帝国西北边陲的战争。事情起于雍正二年(1724年)，青海和硕特蒙古首领罗卜藏丹津叛乱，被年羹尧、岳钟琪荡平。罗卜藏丹津逃亡准噶尔。准噶尔是清廷的老对手了，康熙皇帝披挂上阵，三次亲征准噶尔。

雍正四年，内政整肃完毕，皇帝准备对准噶尔用兵。雍正七年，战争爆发。军情如火，需立即处理，且必须保守秘密。但当时的政治机构却不尽如人意。清承明制，以内阁为国家行政中心。内阁设于紫禁城太和门外的文渊阁附近，而雍正皇帝在养心殿处理政务、就寝，两者相距一千余米。宫禁重重，手续繁多的处理流程，极易延误时机;而军报到京，先经内阁，也容易泄露机密。